Οι υπερηχογραφικές μελέτες εμβρύου στις ημέρες μας μπορούν να ελέγξουν με ακρίβεια την καρδιακή ανατομία μετά την 14η εβδομάδα κύησης. Κατ’αυτόν τον τρόπο γίνεται εφικτή η κατάλληλη συμβουλευτική για τους γονείς προγεννητικά. Μελέτες εχουν δείξει ότι η διάγνωση της καρδιοπάθειας προγεννητικά έχει ευνοική επίδραση στην μετά τη γέννηση κλινική κατάσταση του νεογνού (Prenatal diagnosis of pulmonary atresia: impact on clinical presentation and early outcome. Tzifa A, Barker C, Tibby SM, Simpson JM. Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed. 2007;92(3):F199-203).

Επίσης με τον προγεννητικό έλεγχο διαγιγνώσκονται καρδιακές αρρυθμίες του εμβρύου, οι οποίες όταν χρειάζεται μπορούν να αντιμετωπιστούν με την χορήγηση αντιααρυθμικών φαρμάκων στην μητέρα με από του στόματος αγωγή.